當步進電機驅動器輸出電流較大、驅動電壓較高時，如果其外殼并未采用鋁、鈦、鎂合金外殼進行磁屏蔽，就會對高靈敏的接收機系統造成干擾，使其無法工作，并且污染電源，造成控制系統的單片機和上位機無法進行通訊，嚴重者造成單片機死機，給正常使用造成了困難，因此干擾問題必須加以解決。

可在系統中采取以下措施：

一、加裝電源濾波器，減少對交流電源的污染。

二、一點接地原則：在驅動器與機箱底板絕緣的前提下，將電源濾波器的地、驅動器的地、控制脈沖和方向脈沖共端引出線、電機接地線、驅動器與電機之間電纜防護套、驅動器屏蔽線均接到機箱壁的接地柱上，并做到接觸良好。

三、盡量加大控制線與電源線、電機驅動線之間的距離， 避免交叉。比如我們在處理雙軸驅動系統中兩個處在同一機箱的驅動器安裝位置時，一個驅動器銘牌朝前，另一個則朝后，并在結構布置上使這些引線盡量短。

四、使用屏蔽線減輕外界對本體的干擾，或本體電源線對外界的干擾。

實際運行考驗證明，經過以上處理后的步進電機驅動系統工作可靠。